RNA–Protein interactions for RNA: YJL212C

OPT1, Transcript of Proton-coupled oligopeptide transporter of the plasma membrane, yeast

Gene OPT1, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OPT1	YJL212C	MAK31	P23059	88 aa		4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	ERV15	P38312	142 aa		4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	ERG25	P53045	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YHP1	Q04116	353 aa		4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	SOM1	Q05676	74 aa		4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	MED11	Q99278	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YIL059C	P40520	121 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	SCP1	Q08873	200 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	GTT2	Q12390	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	HAP3	P13434	144 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YKL044W	P36092	106 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YBR242W	P38331	238 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YFR035C	P43608	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	FIG2	P25653	1609 aa		4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	CIS3	P47001	227 aa		4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	KNH1	P50112	268 aa		4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	RAD28	Q12021	506 aa		4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.22	□□□□□ -1.73
OPT1	YJL212C	FYV5	P25585	152 aa		4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	CLB6	P32943	380 aa		4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	SNF11	P38956	169 aa		4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	KRE1	P17260	313 aa		4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YCR099C	P25657	155 aa		4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	MRPS9	P38120	278 aa		4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	QCR10	P37299	77 aa		4.2	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.2	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	KEI1	Q06346	221 aa		4.19	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	AGA2	P32781	87 aa		4.19	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	ATP19	P81451	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	FLO1	P32768	1537 aa		4.18	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	SEC11	P15367	167 aa		4.18	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	UTR5	P32630	166 aa		4.18	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YML079W	Q03629	201 aa		4.18	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YGR269W	P40326	108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YGR164W	P53291	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	DAD4	P69851	72 aa		4.17	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	COX8	P04039	78 aa		4.16	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	PEX4	P29340	183 aa		4.16	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YBR209W	P38311	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.15	□□□□□ -1.74
OPT1	YJL212C	GRX5	Q02784	150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	FIT2	Q08906	153 aa		4.15	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	ERV14	P53173	138 aa		4.14	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	TDA2	P40045	126 aa		4.14	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	NHP10	Q03435	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	GPI19	Q04082	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	ELP6	Q04868	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		4.14	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	RAF1	Q06891	181 aa		4.13	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	VPS68	Q12016	184 aa		4.13	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	YHR130C	P38834	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	SVP26	P38869	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	SPO73	P40031	143 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.1	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	HPA3	P39979	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	ECM29	P38737	1868 aa		4.09	□□□□□ -1.75
OPT1	YJL212C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	STF2	P16965	84 aa		4.09	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	PAU12	P53343	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	UBC4	P15731	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	DCV1	P43595	202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	YPR153W	Q06537	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	MRPL44	P19956	98 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	YHR022C	P38763	256 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	YGL149W	P53116	101 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	AVO2	Q04749	426 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	BRP1	P53194	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	FAB1	P34756	2278 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	MYO1	P08964	1928 aa		4.06	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	YKR045C	P36138	183 aa		4.05	□□□□□ -1.76
OPT1	YJL212C	YFL051C	P43552	160 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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