RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	TIM10	P87108	93 aa		6.2	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YDR042C	Q03205	200 aa		6.2	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	CPT1	P17898	393 aa		6.19	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	PET8	P38921	284 aa		6.19	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	SBH2	P52871	88 aa		6.19	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YLR296W	Q05898	108 aa		6.19	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	DAD1	Q12248	94 aa		6.19	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	MBB1	P39534	108 aa		6.18	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	IMP2	P46972	177 aa		6.18	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YJR096W	P47137	282 aa		6.18	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		6.18	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	MST28	P39552	234 aa		6.17	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YIR020C	P40575	100 aa		6.17	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YKR032W	P36127	104 aa		6.16	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	DGA1	Q08650	418 aa		6.16	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	CDC43	P18898	376 aa		6.15	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YPL073C	P40323	161 aa		6.15	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	ELC1	Q03071	99 aa		6.15	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	YMR103C	Q04436	120 aa		6.15	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
WSC4	YHL028W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	PHO85	P17157	305 aa		6.15	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	VMA11	P32842	164 aa		6.15	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	SNF11	P38956	169 aa		6.15	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YMR181C	Q03231	154 aa		6.15	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YKL069W	P36088	180 aa		6.14	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	MST27	P53176	234 aa		6.14	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	CMC1	P36064	111 aa		6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YGR025W	P53216	100 aa		6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	GPI19	Q04082	140 aa		6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	GEP3	Q08622	556 aa		6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	PRM3	Q08931	133 aa		6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		6.13	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	STF1	P01098	86 aa		6.12	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	DUT1	P33317	147 aa		6.12	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YNL092W	P53934	400 aa		6.12	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	UBC7	Q02159	165 aa		6.12	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YKR041W	P36134	250 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	LCB3	P47013	409 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	DIA1	P54005	336 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	MGR2	Q02889	113 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YML122C	Q03207	126 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YOL160W	Q08321	113 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YLR112W	Q12130	139 aa		6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	AQY1	P0CD91	305 aa		6.1	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YHR140W	P38842	239 aa		6.1	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YER076C	P40049	302 aa		6.1	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YER181C	P40097	107 aa		6.1	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	MSA1	Q08471	629 aa		6.09	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.09	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	MEC1	P38111	2368 aa		6.09	□□□□□ -1.43
WSC4	YHL028W	PFY1	P07274	126 aa		6.09	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	PCL2	P25693	308 aa		6.09	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YGR219W	P53307	113 aa		6.09	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YMR317W	Q04893	1140 aa		6.09	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	ATX1	P38636	73 aa		6.08	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	POR2	P40478	281 aa		6.08	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	ATP23	P53722	227 aa		6.08	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YKL070W	P36087	169 aa		6.07	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	OST2	P46964	130 aa		6.07	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	NCE103	P53615	221 aa		6.07	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YPL261C	Q08976	102 aa		6.07	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	TIM22	Q12328	207 aa		6.07	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	VAR1	P02381	398 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	INO4	P13902	151 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YEL067C	P39978	195 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YNL184C	P53876	108 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	HMRA2	P0CY13	119 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	ISD11	Q6Q560	94 aa		6.06	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	OXA1	P39952	402 aa		6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	TOS6	P48560	102 aa		6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YNR077C	P53758	84 aa		6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YPR013C	Q12145	317 aa		6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	COA3	Q3E7B2	85 aa		6.05	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YFR057W	P43625	151 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YAR1	P46683	200 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	YOL085C	Q99345	113 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	MIC12	P38341	106 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	SPO24	Q3E752	67 aa		6.04	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	TOS8	P53147	276 aa		6.03	□□□□□ -1.44
WSC4	YHL028W	AGA1	P32323	725 aa		6.02	□□□□□ -1.45
WSC4	YHL028W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
WSC4	YHL028W	YFL065C	P43539	102 aa		6.02	□□□□□ -1.45
WSC4	YHL028W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45

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