RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W POM33Q12164 279 aa6.69□□□□□ -1.34
DDI1YER143W MIG1P27705 504 aa6.68□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YKR032WP36127 104 aa6.68□□□□□ -1.34
DDI1YER143W BRP1P53194 125 aa6.68□□□□□ -1.34
DDI1YER143W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
DDI1YER143W SEN15Q04675 128 aa6.68□□□□□ -1.34
DDI1YER143W TMA17Q12513 150 aa6.68□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YHR140WP38842 239 aa6.67□□□□□ -1.34
DDI1YER143W PET8P38921 284 aa6.67□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YBR200W-AQ3E755 54 aa6.67□□□□□ -1.34
DDI1YER143W OST3P48439 350 aa6.66□□□□□ -1.34
DDI1YER143W DUO1P53168 247 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
DDI1YER143W DIA1P54005 336 aa6.66□□□□□ -1.34
DDI1YER143W GSP1P32835 219 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDI1YER143W GSP2P32836 220 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YER134CP40081 178 aa6.65□□□□□ -1.34
DDI1YER143W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDI1YER143W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDI1YER143W FRS1P15624 595 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
DDI1YER143W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W TEM1P38987 245 aa6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W KEG1P43614 200 aa6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W YDR366CP87287 132 aa6.63□□□□□ -1.35
DDI1YER143W Q0255P03881 472 aa6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W VHS2P40463 436 aa6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W YJL028WP47062 111 aa6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W YGL118CP53132 145 aa6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W WIP1Q2V2P8 89 aa6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W YIL134C-AQ45U18 67 aa6.62□□□□□ -1.35
DDI1YER143W RRT13P40042 185 aa6.61□□□□□ -1.35
DDI1YER143W YIL014C-AQ02598 104 aa6.61□□□□□ -1.35
DDI1YER143W COX12Q01519 83 aa6.6□□□□□ -1.35
DDI1YER143W MGR2Q02889 113 aa6.6□□□□□ -1.35
DDI1YER143W AIM34Q03673 198 aa6.6□□□□□ -1.35
DDI1YER143W COA6Q3E846 104 aa6.6□□□□□ -1.35
DDI1YER143W ELF1P36053 145 aa6.59□□□□□ -1.35
DDI1YER143W SEC72P39742 193 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
DDI1YER143W KTI12P34253 313 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
DDI1YER143W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
DDI1YER143W TVP18Q04767 167 aa6.58□□□□□ -1.36
DDI1YER143W MSC3Q05812 728 aa6.58□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YLR281CQ05863 155 aa6.58□□□□□ -1.36
DDI1YER143W NRG2P38082 220 aa6.57□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YCH1P42937 148 aa6.57□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YLR042CQ07990 161 aa6.57□□□□□ -1.36
DDI1YER143W SAL1D6W196 494 aa6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W PFY1P07274 126 aa6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W PRE1P22141 198 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YCR023CP25351 611 aa6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W PAU16P35994 123 aa6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YER076CP40049 302 aa6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W LSM8P47093 109 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
DDI1YER143W AQY1P0CD91 305 aa6.55□□□□□ -1.36
DDI1YER143W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YPR014CQ6B0W2 109 aa6.55□□□□□ -1.36
DDI1YER143W AUA1P32450 94 aa6.54□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YPS5P53057 165 aa6.54□□□□□ -1.36
DDI1YER143W ERV14P53173 138 aa6.54□□□□□ -1.36
DDI1YER143W POP3P53833 195 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
DDI1YER143W ATP23P53722 227 aa6.53□□□□□ -1.36
DDI1YER143W YDR042CQ03205 200 aa6.53□□□□□ -1.36
DDI1YER143W DCV1P43595 202 aa6.52□□□□□ -1.37
DDI1YER143W TOS6P48560 102 aa6.52□□□□□ -1.37
DDI1YER143W DPP1Q05521 289 aa6.52□□□□□ -1.37
DDI1YER143W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YCR001WP25347 104 aa6.51□□□□□ -1.37
DDI1YER143W KRE9P39005 276 aa6.51□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YNL217WP40152 326 aa6.51□□□□□ -1.37
DDI1YER143W GLO1P50107 326 aa6.51□□□□□ -1.37
DDI1YER143W CNL1Q06333 122 aa6.51□□□□□ -1.37
DDI1YER143W PCL2P25693 308 aa6.5□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
DDI1YER143W CGR1P53188 120 aa6.5□□□□□ -1.37
DDI1YER143W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
DDI1YER143W VAM10Q08474 114 aa6.5□□□□□ -1.37
DDI1YER143W SCM4P32564 187 aa6.49□□□□□ -1.37
DDI1YER143W DGA1Q08650 418 aa6.49□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YLR112WQ12130 139 aa6.49□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa6.49□□□□□ -1.37
DDI1YER143W HTL1Q9URQ5 78 aa6.49□□□□□ -1.37
DDI1YER143W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
DDI1YER143W SEC11P15367 167 aa6.48□□□□□ -1.37
DDI1YER143W UBC5P15732 148 aa6.48□□□□□ -1.37
DDI1YER143W FUN14P18411 198 aa6.48□□□□□ -1.37
DDI1YER143W COA3Q3E7B2 85 aa6.48□□□□□ -1.37
DDI1YER143W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
DDI1YER143W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YJR146WP47174 117 aa6.47□□□□□ -1.37
DDI1YER143W SCW10Q04951 389 aa6.47□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YCR075W-AQ3E830 75 aa6.47□□□□□ -1.37
DDI1YER143W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YGR240C-AQ3E786 66 aa6.46□□□□□ -1.38
DDI1YER143W HMRA2P0CY13 119 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20 ms