RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638835.1

CSAG3-203, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG3, Length 793 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-203ENST00000638835 SNX25Q9H3E2 840 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GKN1Q9NS71 199 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 EXOC1Q9NV70 894 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.5□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PHACTR2O75167 634 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TACC1O75410 805 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CLSTN1O94985 981 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PDGFRBP09619 1106 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 USP17L7P0C7H9 530 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TDGF1P13385 188 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 LMO2P25791 158 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GRIK1P39086 918 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 AMPD2Q01433 879 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 SATB1Q01826 763 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 RUNX3Q13761 415 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 DCLK2Q8N568 766 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 SPATA17Q96L03 361 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 EHD2Q9NZN4 543 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 RAB23Q9ULC3 237 aa14.49□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TRIM66O15016 1216 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 FAM163BP0C2L3 166 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 BDNFP23560 247 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ATICP31939 592 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PDE6CP51160 858 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 KRT85P78386 507 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 FOXK2Q01167 660 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PSMD2Q13200 908 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 BIRC3Q13489 604 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CCINQ13939 588 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GAS6Q14393 721 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 KCNB1Q14721 858 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 MTF1Q14872 753 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PDGFRLQ15198 375 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 Q6ZS52 159 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PAGE5Q96GU1 130 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PCED1BQ96HM7 432 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 SPATA32Q96LK8 384 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 EBF3Q9H4W6 596 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 HPS4Q9NQG7 708 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 USP25Q9UHP3 1055 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.48□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 A0A1B0GVL5 298 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 KLRC4O43908 158 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 MYL1P05976 194 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PFKFB1P16118 471 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 AP3M2P53677 418 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 MYL6P60660 151 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 WDR44Q5JSH3 913 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CPA6Q8N4T0 437 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TTC16Q8NEE8 873 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ZNF516Q92618 1163 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 EXOC4Q96A65 974 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CEP250Q9BV73 2442 aa14.47□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 NUP205Q92621 2012 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 A8MXQ7 604 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ARSAP15289 507 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 PFKLP17858 780 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CMA1P23946 247 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 IFNAR2P48551 515 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 CASP4P49662 377 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 STK4Q13043 487 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 USP4Q13107 963 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ZNF77Q15935 545 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ZNF699Q32M78 642 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 RIN3Q8TB24 985 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.46□□□□□ -0.09
CSAG3-203ENST00000638835 ATP2A3Q93084 1043 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms