RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYRFLQ96LU7 910 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MMS19Q96T76 1030 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYT15Q9BQS2 421 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCB6Q9NP58 842 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GCNT4Q9P109 453 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDH9Q9ULB4 789 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CACNA1HO95180 2353 aa6.33□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANTXRLA6NF34 631 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GDF9O60383 454 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CUTAO60888 179 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CKMP06732 381 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP17L7P0C7H9 530 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HDCP19113 662 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SDHBP21912 280 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRIK1P39086 918 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAGEA11P43364 429 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CASP4P49662 377 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP2J2P51589 502 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CACNA2D1P54289 1103 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP46P62068 366 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGAP8P85298 464 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AMPD3Q01432 767 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP24A1Q07973 514 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EHHADHQ08426 723 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CUL4BQ13620 913 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PSMD6Q15008 389 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDGFRLQ15198 375 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SURF1Q15526 300 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC6Q16204 474 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EML3Q32P44 896 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UNC13DQ70J99 1090 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP68Q76N32 757 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CPA6Q8N4T0 437 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IQUBQ8NA54 791 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF516Q92618 1163 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPATA17Q96L03 361 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FNBP1Q96RU3 617 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CGRRF1Q99675 332 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RTKNQ9BST9 563 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CUEDC2Q9H467 287 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ECT2Q9H8V3 914 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.32□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UBE4BO95155 1302 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 F8VP50 259 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLDN5O00501 218 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIM66O15016 1216 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AXIN1O15169 862 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRP3O75074 770 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATG13O75143 517 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TACC1O75410 805 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 F13A1P00488 732 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC192P0DO97 292 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TCF3P15923 654 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DRD1P21728 446 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANXA13P27216 316 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXA6P31267 233 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OPRD1P41143 372 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AFMP43652 599 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDH8P55286 799 aa6.31□□□□□ -1.4
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYL6P60660 151 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms