RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SNX19Q92543 992 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 BDH2Q9BUT1 245 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MAGEH1Q9H213 219 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CD248Q9HCU0 757 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MYADML2A6NDP7 307 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ACKR2O00590 384 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TRIM38O00635 465 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SRGAP2O75044 1071 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 COQ9O75208 318 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZFPL1O95159 310 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 EGR1P18146 543 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNA3P22001 575 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ACRV1P26436 265 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 E2F2Q14209 437 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 GEN1Q17RS7 908 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FAXCQ5TGI0 409 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT73Q86Y46 540 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SPARTQ8N0X7 666 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CHST13Q8NET6 341 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 STYXQ8WUJ0 223 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 HPSEQ9Y251 543 aa6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0B4J269 797 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TRIAP1O43715 76 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM20BO75063 409 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NCR1O76036 304 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TNFRSF6BO95407 300 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CD6P30203 668 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SELENOPP49908 381 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM189BP81408 668 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FSTL1Q12841 308 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TUBB3Q13509 450 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PRKG1Q13976 671 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CYP2A13Q16696 494 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 BOD1Q96IK1 185 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NELL2Q99435 816 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.34□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GAGE12BA1L429 117 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 HOXA5P20719 270 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 FOXO1Q12778 655 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 RESTQ13127 1097 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 MANEALQ5VSG8 457 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 MZT2AQ6P582 158 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 NACC2Q96BF6 587 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.33□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ASNA1O43681 348 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 NDUFA10O95299 355 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 ITGA5P08648 1049 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMARCA2-241ENST00000635397 PPFIA1Q13136 1202 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms