RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629912.1

NEK3-211, Transcript of NIMA related kinase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEK3, Length 141 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3-211ENST00000629912 AKAP5P24588 427 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 KLRC2P26717 231 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CST5P28325 142 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 FLT3LGP49771 235 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TAF6P49848 677 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ARSEP51690 589 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 LILRA4P59901 499 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SLC6A3Q01959 620 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 KRT17Q04695 432 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ZNF844Q08AG5 666 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 MGAT3Q09327 533 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CALCOCO2Q13137 446 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CBLBQ13191 982 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SNX1Q13596 522 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PPP1R7Q15435 360 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SV2CQ496J9 727 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 BOLA3Q53S33 107 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TFDP3Q5H9I0 405 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 FAM26DQ5JW98 314 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 C6orf118Q5T5N4 469 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 BBS12Q6ZW61 710 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ACOT1Q86TX2 421 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SERINC5Q86VE9 423 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 FAM228AQ86W67 206 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 VSIG1Q86XK7 387 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 HACE1Q8IYU2 909 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CCDC89Q8N998 374 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TEKT4Q8WW24 435 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 HSFY1Q96LI6 401 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SYNCQ9H7C4 482 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 HESX1Q9UBX0 185 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TSPAN16Q9UKR8 245 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 GABRQQ9UN88 632 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 GINS2Q9Y248 185 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 HES2Q9Y543 173 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 NME7Q9Y5B8 376 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SQORQ9Y6N5 450 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.85□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 A8MXQ7 604 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ZNF487B1APH4 448 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PI4K2BG5E9Z4 385 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PTGESO14684 152 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 GABRDO14764 452 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 GPR182O15218 404 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SPTLC1O15269 473 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 HUS1O60921 280 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 TCEA3O75764 348 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 GABBR2O75899 941 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CABYRO75952 493 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CHRNA1P02708 482 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 KRT1P04264 644 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 RARBP10826 455 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 FGFR1P11362 822 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 KRT10P13645 584 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ATF2P15336 505 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PDGFRAP16234 1089 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 IL1R2P27930 398 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 MIPP30301 263 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ACTN2P35609 894 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ADCY8P40145 1251 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PTPN9P43378 593 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ACADSBP45954 432 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 IRAK1P51617 712 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 ADCY2Q08462 1091 aa5.84□□□□□ -1.47
NEK3-211ENST00000629912 PDE4CQ08493 712 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms