RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 MSANTD3Q96H12 275 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 PCED1BQ96HM7 432 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TIGD1Q96MW7 591 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 GKN1Q9NS71 199 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TDP1Q9NUW8 608 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 OBP2AQ9NY56 170 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 NOTCH4Q99466 2003 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 AKAP3O75969 853 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 NOL4O94818 638 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 HLA-DRAP01903 254 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 F11P03951 625 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 HDCP19113 662 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 YWHAQP27348 245 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 WEE1P30291 646 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 GTF2H1P32780 548 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 PRCPP42785 496 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 RAP1GAPP47736 663 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 NDST1P52848 882 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CLDN10P78369 228 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 NR1H3Q13133 447 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 LRRC32Q14392 662 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CCDC142Q17RM4 750 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ZACNQ401N2 412 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 KRT39Q6A163 491 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ISM2Q6H9L7 571 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 POTEHQ6S545 545 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ACOT1Q86TX2 421 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 NUP93Q8N1F7 819 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 STKLD1Q8NE28 680 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TTC8Q8TAM2 541 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 SPATA17Q96L03 361 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 MYRFLQ96LU7 910 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 PKMYT1Q99640 499 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 IL21Q9HBE4 155 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 TSC2P49815 1807 aa6.46□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.46□□□□□ -1.37
CCL23-201ENST00000612516 BICDL2A1A5D9 508 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 F8VP50 259 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 CLDN5O00501 218 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 GFRA3O60609 400 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 LRRN2O75325 713 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 AP1G2O75843 785 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 VNN1O95497 513 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 PRAMEF12O95522 483 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 TRIM49P0CI25 452 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 TRIM49CP0CI26 452 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 CD58P19256 250 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 IFNAR2P48551 515 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 MXI1P50539 228 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 SLC8A3P57103 927 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 LRRC63Q05C16 580 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 ENPEPQ07075 957 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL23-201ENST00000612516 CETN1Q12798 172 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms