RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	RRM1	P23921	792 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	EPHB2	P29323	1055 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SDC4	P31431	198 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PSMC6	P62333	389 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NCOA4	Q13772	614 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PSMD6	Q15008	389 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	UGP2	Q16851	508 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DOK7	Q18PE1	504 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	NXN	Q6DKJ4	435 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM13C	Q8NE31	585 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAR2	Q96K12	515 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	C8orf37	Q96NL8	207 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FBXO40	Q9UH90	709 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	LAMB1	P07942	1786 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FCHO1	O14526	889 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MEIS2	O14770	477 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PFDN6	O15212	129 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MTSS1	O43312	755 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	LIAS	O43766	372 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CST8	O60676	142 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RBP3	P10745	1247 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PAM	P19021	973 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	KLRK1	P26718	216 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RANBP1	P43487	201 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CASP5	P51878	434 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RHBDL3	P58872	404 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RAB15	P59190	212 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	UBXN2A	P68543	259 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FMO1	Q01740	532 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GABPA	Q06546	454 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GALNTL6	Q49A17	601 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DPH6	Q7L8W6	267 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FITM2	Q8N6M3	262 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CERK	Q8TCT0	537 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	JDP2	Q8WYK2	163 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	SCYL1	Q96KG9	808 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	MCEE	Q96PE7	176 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TBCB	Q99426	244 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	BFAR	Q9NZS9	450 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	VAV3	Q9UKW4	847 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TMCO1	Q9UM00	188 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	POLI	Q9UNA4	740 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	USP20	Q9Y2K6	914 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	C2CD2	Q9Y426	696 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM86B1	E9PN63	330 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	DNAJC6	O75061	913 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CRCP	O75575	148 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CYP2C8	P10632	490 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CCDC130	P13994	396 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	PTPN7	P35236	360 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	RARRES1	P49788	294 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	CDH6	P55285	790 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	KCNQ4	P56696	695 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VMP1-216	ENST00000592790	KDSR	Q06136	332 aa		3.68	□□□□□ -1.82

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