RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM71BQ8TC56 605 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF480Q8WV37 535 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 STON2Q8WXE9 905 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG3Q92685 438 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RILPL2Q969X0 211 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX11Q96FC9 970 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR92Q96MX6 357 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT3Q9BQG1 590 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TLR9Q9NR96 1032 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LANCL2Q9NS86 450 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PHLPP1O60346 1717 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DOT1LQ8TEK3 1739 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH3P11055 1940 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT10BO00744 389 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PIP5K1BO14986 540 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY6O43306 1168 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FIBPO43427 364 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR32O75388 356 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF6BO95407 300 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MATN4O95460 622 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 C8BP07358 591 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IL1R1P14778 569 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IL2RBP14784 551 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FPR1P21462 350 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMLP26374 656 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ELF1P32519 619 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY8P40145 1251 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PIK3CGP48736 1102 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MCM2P49736 904 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CTXN1P60606 82 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CTBP1Q13363 440 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FYB2Q5VWT5 728 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LIN54Q6MZP7 749 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BORAQ6PGQ7 559 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF44Q7L0R7 432 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 STPG3Q8N7X2 389 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 REPS2Q8NFH8 660 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC46Q96FV0 321 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST8Q9H2A9 424 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KCND1Q9NSA2 647 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SRRDQ9UH36 339 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 COL15A1P39059 1388 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SPEF2Q9C093 1822 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NRAPQ86VF7 1730 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TNS2Q63HR2 1409 aa4.72□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0B4J269 797 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0G2JNJ9 132 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NLC8 198 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 B4E171 279 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 MSTNO14793 375 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPNS1-210ENST00000590211 ITGA5P08648 1049 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRB3P28472 473 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN7P41732 249 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 PHKA1P46020 1223 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNJ5P48544 419 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 CARSP49589 748 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPNS1-210ENST00000590211 COPS6Q7L5N1 327 aa4.71□□□□□ -1.66
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