RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TIMP1P01033 207 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 NPR3P17342 541 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ADORA2BP29275 332 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PAFAH1B1P43034 410 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MARCKSL1P49006 195 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 DNA2P51530 1060 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 OGDHQ02218 1023 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPROQ16827 1216 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PMF1Q6P1K2 205 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM35AQ86V20 835 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 UBXN4Q92575 508 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.99■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 F8W810 466 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 I3L4J1 428 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TULP2O00295 520 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 DPYSL4O14531 572 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SYN3O14994 580 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 EFCAB14O75071 495 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ATP2C2O75185 946 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 GJB6O95452 261 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 KRT3P12035 628 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ACADSBP45954 432 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 IKBKEQ14164 716 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ELF2Q15723 593 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC142Q17RM4 750 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TEX35Q5T0J7 233 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 LRRC38Q5VT99 294 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 OVOS1Q6IE37 1185 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM171BQ6P995 826 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ARCQ7LC44 396 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 HASPINQ8TF76 798 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.159e-10■■□□□ 12.6
EFTUD2-214ENST00000589769 DUSP16Q9BY84 665 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MARCH5Q9NX47 278 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 EHD2Q9NZN4 543 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TRAPPC3O43617 180 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 CEP104O60308 925 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 GABBR2O75899 941 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 OAZ2O95190 189 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM200BP0CF97 657 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 OR1G1P47890 313 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 GATMP50440 423 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RWDD2BP57060 319 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ACAP1Q15027 740 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKRD7Q92527 254 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PCED1BQ96HM7 432 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MS4A14Q96JA4 679 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ST7Q9NRC1 585 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 KRT82Q9NSB4 513 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPRSQ13332 1948 aa15.97■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 ITGB8P26012 769 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC11A1P49279 550 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 RGS7P49802 495 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms