RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 YIPF1Q9Y548 306 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 VWA8A3KMH1 1905 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 RFPL2O75678 378 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 AP1G2O75843 785 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 SEC24AO95486 1093 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 PAEPP09466 180 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 TPM1P09493 284 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 FAM200BP0CF97 657 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 CCDC130P13994 396 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 UCHL3P15374 230 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 CYP2F1P24903 491 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 HOXA9P31269 272 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 BPIFB4P59827 614 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 NHLH1Q02575 133 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 PTK2Q05397 1052 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 FAM171BQ6P995 826 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 GJB7Q6PEY0 223 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 TRIM5Q9C035 493 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 S1PR5Q9H228 398 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 KRT82Q9NSB4 513 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-215ENST00000584944 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GTH6 734 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 FGF19O95750 216 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CCDC172P0C7W6 258 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 VDRP11473 427 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 PTPN2P17706 415 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 MAGEA11P43364 429 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 RAD23BP54727 409 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 ZXDAP98168 799 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 APBA1Q02410 837 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 STILQ15468 1287 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 FAM35AQ86V20 835 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 C12orf29Q8N999 325 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 KAT5Q92993 513 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CORO1BQ9BR76 489 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 STK33Q9BYT3 514 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 ASAH2Q9NR71 780 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 ASB3Q9Y575 518 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 TSC2P49815 1807 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1W2PQC6 194 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM221A6NGB7 291 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 M0R296 226 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CLDN5O00501 218 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 THAP12O43422 761 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 SOAT2O75908 522 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 KRT9P35527 623 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 KCNMA1Q12791 1236 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 DDR2Q16832 855 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 GPR149Q86SP6 731 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 LEMD2Q8NC56 503 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 GIPC2Q8TF65 315 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 IQCDQ96DY2 449 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 TWNKQ96RR1 684 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 NUP58Q9BVL2 599 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CEP83Q9Y592 693 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 F8VP50 259 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF197O14709 1029 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 TEX33O43247 280 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CSH1P0DML2 217 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 CSH2P0DML3 217 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 MYL4P12829 197 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 GNA15P30679 374 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 STAT1P42224 750 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 KLK7P49862 253 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 MRE11P49959 708 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 PDE6CP51160 858 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-215ENST00000584944 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms