RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 DERAQ9Y315 318 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0B4J269 797 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 ANTXRLA6NF34 631 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 MYMKA6NI61 221 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 FAM189A1O60320 539 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRM-210ENST00000578916 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 8.4
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PTPRM-210ENST00000578916 FRMD1Q8N878 549 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 FSIP1Q8NA03 581 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPRM-210ENST00000578916 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRM-210ENST00000578916 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 K7ENM7 598 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 LAD1O00515 517 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-210ENST00000578916 EMC10Q5UCC4 262 aa9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-210ENST00000578916 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB119Q8N690 84 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 MYCT1Q8N699 235 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC15Q8TF66 581 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 KCNN1Q92952 543 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRM-210ENST00000578916 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.79□□□□□ -0.84
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