RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MYO19	Q96H55	970 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NACC1	Q96RE7	527 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	HPS4	Q9NQG7	708 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PATE3	B3GLJ2	98 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TNFRSF10B	O14763	440 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CPLX1	O14810	134 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ABL1	P00519	1130 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CPA1	P15085	419 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	XBP1	P17861	261 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CYP11B2	P19099	503 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MSX1	P28360	303 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	HOXD12	P35452	270 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DGKE	P52429	567 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DUSP4	Q13115	394 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	APC2	O95996	2303 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PI4KA	P42356	2102 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CIT	O14578	2027 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GALK1	P51570	392 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCAP	Q12770	1279 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	VEPH1	Q14D04	833 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PDGFRL	Q15198	375 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NLRP8	Q86W28	1048 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SYT12	Q8IV01	421 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEP120	Q8N960	986 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	IFT74	Q96LB3	600 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDT1	Q9H211	546 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EBF3	Q9H4W6	596 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MTMR11	A4FU01	709 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932		K7ERI5	159 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	MCF2	P10911	925 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	ENG	P17813	658 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	LIG1	P18858	919 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	PAX3	P23760	479 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMA5	P28066	241 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	GJA4	P35212	333 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	AVPR1A	P37288	418 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	CALCRL	Q16602	461 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TOM1L1-223	ENST00000576932	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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