RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 C2orf78A6NCI8 922 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ZNF806P0C7X5 589 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 TCF3P15923 654 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 LMO2P25791 158 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 LIMK1P53667 647 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CCDC6Q16204 474 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CD101Q93033 1021 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ATP2A3Q93084 1043 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 MYLPFQ96A32 169 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 HPDLQ96IR7 371 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 HHIPQ96QV1 700 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 RXFP3Q9NSD7 469 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CDH9Q9ULB4 789 aa23.62■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CCDC192P0DO97 292 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 HOXD13P35453 343 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 IFNAR2P48551 515 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 MYO1EQ12965 1108 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 PLA2G2CQ5R387 149 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 SYT13Q7L8C5 426 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 PDILTQ8N807 584 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 FSIP1Q8NA03 581 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 HPS3Q969F9 1004 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 EXOC4Q96A65 974 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 SPATA17Q96L03 361 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.61■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ZNF233A6NK53 670 aa23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 SURF1Q15526 300 aa23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 VSTM1Q6UX27 236 aa23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 TNMDQ9H2S6 317 aa23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa23.6■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 TM4SF5O14894 197 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 TNNC2P02585 160 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 USP46P62068 366 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ZXDBP98169 803 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 KCNB1Q14721 858 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 E2F4Q16254 413 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 PLK5Q496M5 336 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 WDR49Q8IV35 697 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 TTC16Q8NEE8 873 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 NME7Q9Y5B8 376 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 EML5Q05BV3 1969 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.59■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 HDCP19113 662 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 BDNFP23560 247 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 DMC1Q14565 340 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 ACDQ96AP0 544 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 PCED1BQ96HM7 432 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 TRIM9Q9C026 710 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 EBF1Q9UH73 591 aa23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
E2F4-210ENST00000568485 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 PFKLP17858 780 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 MPLP40238 635 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 IL31Q6EBC2 164 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.57■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 KRT37O76014 449 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 APBB3O95704 486 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 PDGFRBP09619 1106 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 GRIK1P39086 918 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 PDE6CP51160 858 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 GAB4Q2WGN9 574 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
E2F4-210ENST00000568485 ATG2BQ96BY7 2078 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms