RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568153.1

CAPN3-218, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-218ENST00000568153 KPNA6O60684 536 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 NOL4O94818 638 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TNNT1P13805 278 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SLC9A1P19634 815 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 HOXD10P28358 340 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ADSSP30520 456 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GTF2H1P32780 548 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CYP2C19P33261 490 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FMO5P49326 533 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 IGBP1P78318 339 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 KRT83P78385 493 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ENPEPQ07075 957 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 BFSP1Q12934 665 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MEA1Q16626 185 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CCL14Q16627 93 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MAPK6Q16659 721 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GPD1LQ8N335 351 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC42Q96M95 316 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CHP1Q99653 195 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 APBA2Q99767 749 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TCHPQ9BT92 498 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MYO6Q9UM54 1294 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SHISA3A0PJX4 238 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 USP27XA6NNY8 438 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 WASH4PA8MWX3 477 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CLDN3O15551 220 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 C22orf31O95567 290 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PIGRP01833 764 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 COL1A2P08123 1366 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MMP3P08254 477 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC175P0C221 793 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SRFP11831 508 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ACTN1P12814 892 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 UCHL3P15374 230 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CPT1AP50416 773 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SP3Q02447 781 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 DRP2Q13474 957 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CAPSQ13938 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MTF1Q14872 753 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SPA17Q15506 151 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PDXDC1Q6P996 788 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 WDR59Q6PJI9 974 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ZPBP2Q6X784 338 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 RNF149Q8NC42 400 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 CAPNS2Q96L46 248 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FZD8Q9H461 694 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 OTOFQ9HC10 1997 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 NRCAMQ92823 1304 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 A0A0B4J269 797 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 LRRC53A6NM62 1247 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 ACKR2O00590 384 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 EPHB6O15197 1021 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPN3-218ENST00000568153 SHOXO15266 292 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms