RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM3CQ92520 227 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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RABGGTA-210ENST00000559586 YIPF1Q9Y548 306 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 FGF19O95750 216 aa21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-210ENST00000559586 STX17P56962 302 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP8P85298 464 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 PAK1Q13153 545 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF699Q32M78 642 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-210ENST00000559586 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP63Q96MT8 703 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 MMS19Q96T76 1030 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 SDCBP2Q9H190 292 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 RAB23Q9ULC3 237 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 ASB3Q9Y575 518 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP2C2O75185 946 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 SOAT2O75908 522 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM163BP0C2L3 166 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 GTF2H1P32780 548 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 MYL7Q01449 175 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM171BQ6P995 826 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC35C1Q96A29 364 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPRDP23468 1912 aa21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 COL4A3Q01955 1670 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.38■■□□□ 1.01
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RABGGTA-210ENST00000559586 MOSPD3O75425 235 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 VIPR2P41587 438 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 CDH8P55286 799 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 TNNC1P63316 161 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 TSPY1Q01534 308 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 LMNB2Q03252 620 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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RABGGTA-210ENST00000559586 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC3Q9BY71 257 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.38■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 BICDL2A1A5D9 508 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 CHADO15335 359 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 ATF6P18850 670 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 PCSK1P29120 753 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 PIK3CAP42336 1068 aa21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC32Q14392 662 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 TEAD2Q15562 447 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 CBWD6Q4V339 395 aa21.37■■□□□ 1.01
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RABGGTA-210ENST00000559586 SYT15Q9BQS2 421 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.37■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 PDGFRBP09619 1106 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 ASPAP45381 313 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGGTA-210ENST00000559586 RAP1GAPP47736 663 aa21.36■■□□□ 1.01
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