RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TTC8	Q8TAM2	541 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	FGF13	Q92913	245 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MED10	Q9BTT4	135 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TECTA	O75443	2155 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PTPRD	P23468	1912 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MOSPD3	O75425	235 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KRT31	Q15323	416 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	FUK	Q8N0W3	1084 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	F5	P12259	2224 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MAPK13	O15264	365 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	NCK2	O43639	380 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	USP8	P40818	1118 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ALDH1A3	P47895	512 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ITIH3	Q06033	890 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	DSE	Q9UL01	958 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CLUH	O75153	1309 aa		10.75	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TEX33	O43247	280 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
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FAM227B-208	ENST00000559573	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	FSHR	P23945	695 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GABRR2	P28476	465 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ATIC	P31939	592 aa		10.74	□□□□□ -0.69
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FAM227B-208	ENST00000559573	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TXNDC8	Q6A555	127 aa		10.74	□□□□□ -0.69
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FAM227B-208	ENST00000559573	TMC8	Q8IU68	726 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		10.74	□□□□□ -0.69
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FAM227B-208	ENST00000559573	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	RIN3	Q8TB24	985 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CCL26	Q9Y258	94 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	C2orf78	A6NCI8	922 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	CILP	O75339	1184 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	PON1	P27169	355 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF165	P49910	485 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	GRM2	Q14416	872 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		10.74	□□□□□ -0.69
FAM227B-208	ENST00000559573	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		10.74	□□□□□ -0.69

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