RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM127O75204 238 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG7O75391 227 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AXLP30530 894 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1AP35813 382 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MSH2P43246 934 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EPHB4P54760 987 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A2P55011 1212 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 BLMHQ13867 455 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SV2CQ496J9 727 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PREBQ9HCU5 417 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IL20Q9NYY1 176 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IKBKBO14920 756 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RGS20O76081 388 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MMP1P03956 469 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PDHA2P29803 388 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SULT1E1P49888 294 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPARCL1Q14515 664 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ARL5BQ96KC2 179 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 WDR18Q9BV38 432 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ABCG8Q9H221 673 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ECT2Q9H8V3 914 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 BARHL2Q9NY43 387 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLIT2O94813 1529 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 UBE4BO95155 1302 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM228BP0C875 321 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HALP42357 657 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN5P54829 565 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DEFA1P59665 94 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DEFA3P59666 94 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH2Q12809 1159 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRP8Q14114 963 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC142Q17RM4 750 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DACT2Q5SW24 774 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KRT80Q6KB66 452 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NELFBQ8WX92 580 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EME1Q96AY2 570 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PRRG1O14668 218 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL41O60662 606 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CRCPO75575 148 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PDE9AO76083 593 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL18O94889 574 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ITGB3P05106 788 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GHRP10912 638 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CKBP12277 381 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CMA1P23946 247 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HNF1BP35680 557 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFV1P49821 464 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM17P78536 824 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM9Q13443 819 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MAPRE2Q15555 327 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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