RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548211.1

RPAP3-205, Transcript of RNA polymerase II associated protein 3, human

TSL 2

Gene RPAP3, Length 555 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPAP3-205	ENST00000548211	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPAP3-205	ENST00000548211	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPAP3-205	ENST00000548211	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPAP3-205	ENST00000548211	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPAP3-205	ENST00000548211	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPAP3-205	ENST00000548211	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	GABRD	O14764	452 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	GNAI3	P08754	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	NDUFB7	P17568	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ITGAL	P20701	1170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CTGF	P29279	349 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PRDX5	P30044	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CD6	P30203	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CYP2C19	P33261	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	LIPA	P38571	399 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	GNAI1	P63096	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211		H0YIZ8	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	JTB	O76095	146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	RARB	P10826	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CLCN2	P51788	898 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF134	P52741	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TUBA4A	P68366	448 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	KIF22	Q14807	665 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	USP37	Q86T82	979 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211		M0QYG6	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PPP6C	O00743	305 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	KATNA1	O75449	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CLSTN1	O94985	981 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	CYP2C18	P33260	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ITK	Q08881	620 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TCF15	Q12870	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	LRP6	O75581	1613 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	AFF2	P51816	1311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPAP3-205	ENST00000548211	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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