RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 CILPO75339 1184 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 PPP3CCP48454 512 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 NDST1P52848 882 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.76■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 WDR44Q5JSH3 913 aa24.75■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 COL9A1P20849 921 aa24.74■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 GPR158Q5T848 1215 aa24.74■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 KRBA1A5PL33 1030 aa24.73■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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CTDSP2-203ENST00000547701 FBXL21Q9UKT6 434 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 PATJQ8NI35 1801 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 COL4A2P08572 1712 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 ARNTLO00327 626 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 CHADO15335 359 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDSP2-203ENST00000547701 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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