RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 C8orf74Q6P047 294 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MON1BQ7L1V2 547 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ACAP3Q96P50 834 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 OSMRQ99650 979 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CARD9Q9H257 536 aa8.2□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GINS2Q9Y248 185 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 C2CD2Q9Y426 696 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PCNTO95613 3336 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 RRM1P23921 792 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 LIN9Q5TKA1 542 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NOTUMQ6P988 496 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 C16orf87Q6PH81 154 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PASD1Q8IV76 773 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CD302Q8IX05 232 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 PLPP6Q8IY26 295 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TRPV1Q8NER1 839 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 BTBD6Q96KE9 485 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF570Q96NI8 536 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZIC5Q96T25 663 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KRT12Q99456 494 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CORO1BQ9BR76 489 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 STIM2Q9P246 746 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 POLIQ9UNA4 740 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 CCDC188H7C350 402 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AGPSO00116 658 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KRIT1O00522 736 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 TREHO43280 583 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SPOPO43791 374 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KPNA6O60684 536 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZMYND10O75800 440 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ANP32DO95626 131 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 CYBAP13498 195 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 TNFRSF8P28908 595 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 AXLP30530 894 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 HOXC8P31273 242 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 GGCXP38435 758 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 SCNN1BP51168 640 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-204ENST00000546621 PTP4A2Q12974 167 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-204ENST00000546621 KRT72Q14CN4 511 aa8.19□□□□□ -1.1
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