RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DHX58Q96C10 678 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TTC1Q99614 292 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CASZ1Q86V15 1759 aa6.07□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 F5H6K3 240 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB5O15062 677 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 OFD1O75665 1012 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TPM3P06753 285 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CPEP16870 476 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 BPIP17213 487 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PTGS1P23219 599 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CDC25AP30304 524 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PRPHP41219 470 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KIF11P52732 1056 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KLRC3Q07444 240 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 DLGAP5Q15398 846 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TBCKQ8TEA7 893 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LRRC15Q8TF66 581 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 DPF2Q92785 391 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 DLG3Q92796 817 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SMARCE1Q969G3 411 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 IFT22Q9H7X7 185 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CNTNAP1P78357 1384 aa6.06□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TCHHQ07283 1943 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SLX4Q8IY92 1834 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SHTN1A0MZ66 631 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CLRN2A0PK11 232 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PP2D1A8MPX8 630 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 H0Y858 1186 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LAD1O00515 517 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 GH2P01242 217 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ATP1A3P13637 1013 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SLC1A4P43007 532 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MMP14P50281 582 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ADCY7P51828 1080 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 IGBP1P78318 339 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ICA1Q05084 483 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 STAT4Q14765 748 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CCDC96Q2M329 555 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LETM2Q2VYF4 491 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NEK8Q86SG6 692 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 IQUBQ8NA54 791 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MLKLQ8NB16 471 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 STAMQ92783 540 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MTMR9Q96QG7 549 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MCM8Q9UJA3 840 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.05□□□□□ -1.44
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