RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0B4J269	797 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TISP43	B9A030	160 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557		H0Y626	953 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MAST4	O15021	2626 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	OGT	O15294	1046 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MAP3K13	O43283	966 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	GJB3	O75712	270 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM16	O95361	564 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	SEC24B	O95487	1268 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PRB1	P04280	392 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	TIE1	P35590	1138 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	WNT7B	P56706	349 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PLIN2	Q99541	437 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CYP17A1	P05093	508 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CKM	P06732	381 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINF2	P08697	491 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CSH1	P0DML2	217 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CSH2	P0DML3	217 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ACOT2	P49753	483 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	OPHN1	O60890	802 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	PIGR	P01833	764 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	KCNN1	Q92952	543 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	BICD1	Q96G01	975 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CD93	Q9NPY3	652 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	DSE	Q9UL01	958 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	LEFTY2	O00292	366 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP33	O14559	1287 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TCF3	P15923	654 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	GABRG2	P18507	467 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	HDC	P19113	662 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TAF6	P49848	677 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	LIG4	P49917	911 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	SMTN	P53814	917 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	USP46	P62068	366 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	NR1H3	Q13133	447 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM29	Q14134	588 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	DHCR24	Q15392	516 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.06	□□□□□ -0.32
BBS1-222	ENST00000533557	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms