RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-208	ENST00000526317	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MED10	Q9BTT4	135 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KCNK12	Q9HB15	430 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317		F8VP50	259 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TRIM66	O15016	1216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	BEST1	O76090	585 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NOL4	O94818	638 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FGF19	O95750	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CCDC130	P13994	396 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NCAPH	Q15003	741 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TEAD2	Q15562	447 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PARM1	Q6UWI2	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PTPRD	P23468	1912 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DCX	O43602	365 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	AP1G2	O75843	785 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ALAD	P13716	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PON1	P27169	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ANXA13	P27216	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ADORA2B	P29275	332 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZXDA	P98168	799 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MYL5	Q02045	173 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GCNT1	Q02742	428 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TDG	Q13569	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	EDA	Q92838	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FGF14	Q92915	247 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SMO	Q99835	787 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	VPS16	Q9H269	839 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	VCAN	P13611	3396 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ATP8B3	O60423	1300 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	SYCE3	A1L190	88 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CDC25C	P30307	473 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	USP46	P62068	366 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	CYP4F8	P98187	520 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	APBA1	Q02410	837 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	HTR4	Q13639	388 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	KRT31	Q15323	416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CSRP1-208	ENST00000526317	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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