RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNJ5P48544 419 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 IQCB1Q15051 598 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMOTQ4VCS5 1084 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 EMC10Q5UCC4 262 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 DENND2CQ68D51 928 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 DLK2Q6UY11 383 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CPA6Q8N4T0 437 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNTD1Q8N815 330 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 NRACQ8N912 160 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF398Q8TD17 642 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SOCS4Q8WXH5 440 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATG4AQ8WYN0 398 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KAT5Q92993 513 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RSPRY1Q96DX4 576 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 POT1Q9NUX5 634 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAFFQ9ULX9 164 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SHOC2Q9UQ13 582 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TLDC2A0PJX2 215 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 A1L4Q6 167 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS29PA6NIE9 313 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD8B2A6NJW9 211 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 M0R3H8 397 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FZD9O00144 591 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FCHO1O14526 889 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERC2O15083 957 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 VPS4BO75351 444 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FESP07332 822 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP2C9P11712 490 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE6CP51160 858 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RENBPP51606 427 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 DSC2Q02487 901 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERV3-1Q14264 604 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FCRL6Q6DN72 434 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SFTPA1Q8IWL2 248 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 GLG1Q92896 1179 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAXDC2Q96IV6 333 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TEKT5Q96M29 485 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC46A1Q96NT5 459 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC5A4Q9NY91 659 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLHL13Q9P2N7 655 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGAP1Q9UPQ3 857 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SHTN1A0MZ66 631 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 XPOTO43592 962 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TULP3O75386 442 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ABLIM3O94929 683 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDHA1P08559 390 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 T-ENOLP0DO92 83 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRF1P14222 555 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 HK3P52790 923 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 NOGQ13253 232 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM187BQ17R55 369 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 UAP1L1Q3KQV9 507 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGAP40Q5TG30 622 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIM3Q86V86 326 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM46DQ8NEK8 389 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAMKK2Q96RR4 588 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 CIPCQ9C0C6 399 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERTAD3Q9UJW9 196 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS44E7EML9 344 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 EXOC3O60645 756 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TOMM40O96008 361 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 TGFB3P10600 412 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 IARSP41252 1262 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 WNT3P56703 355 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ID2Q02363 134 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 LEXMQ3ZCV2 418 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYDE2Q5VT97 1194 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRT78Q8N1N4 520 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 MIER2Q8N344 545 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-397P-201ENST00000516226 XAGE5Q8WWM1 108 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms