RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RARGP13631 454 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FPR2P25090 351 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MTHFRP42898 656 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SGCGQ13326 291 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CTBP1Q13363 440 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RABEP1Q15276 862 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MED22Q15528 200 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DBN1Q16643 649 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALG11Q2TAA5 492 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BTBD16Q32M84 506 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADALQ6DHV7 355 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MPP5Q8N3R9 675 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 USP38Q8NB14 1042 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TCTN2Q96GX1 697 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMX3Q96JJ7 454 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ABHD1Q96SE0 405 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FUZQ9BT04 418 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 WDCPQ9H6R7 721 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IL21RQ9HBE5 538 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VEZTQ9HBM0 779 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SHISA3A0PJX4 238 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A4D1N5 150 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A8MVJ9 347 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM233B4DJY2 109 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 H7C1W4 665 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBXN8O00124 270 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RASSF9O75901 435 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMPD1P17405 629 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EGR1P18146 543 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KLRK1P26718 216 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SULT1E1P49888 294 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HTD2P86397 168 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC6A3Q01959 620 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RPA4Q13156 261 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CEP55Q53EZ4 464 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GAREM2Q75VX8 874 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DYMQ7RTS9 669 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DPP10Q8N608 796 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF384Q8TF68 577 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GAB3Q8WWW8 586 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCDC114Q96M63 670 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GBP4Q96PP9 640 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GSDMAQ96QA5 445 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRAM1Q96QH2 718 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPXQ9BT56 116 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TEX12Q9BXU0 123 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DPH1Q9BZG8 443 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VPS16Q9H269 839 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms