RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514893.5

NEDD4-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4-211	ENST00000514893	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893		M0QYG6	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PRKCB	P05771	671 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	HSD3B2	P26439	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	IQCB1	Q15051	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PIM3	Q86V86	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	LOXL3	P58215	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SP2	Q02086	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893		H3BNX3	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PDE8B	O95263	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SATB1	Q01826	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SLC16A6	O15403	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ME1	P48163	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	RENBP	P51606	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	HYAL1	Q12794	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ADAM10	O14672	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	DCLK1	O15075	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ERC2	O15083	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	GCAT	O75600	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	RNF8	O76064	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	CLSTN1	O94985	981 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	PHKG2	P15735	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	LILRA4	P59901	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	KRT85	P78386	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4-211	ENST00000514893	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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