RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BDNFP23560 247 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNE1P24864 410 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRIK1P39086 918 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP27A1Q02318 531 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCOA4Q13772 614 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TXNDC8Q6A555 127 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAF4BQ92750 862 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDPD2Q9HCC8 539 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO15AQ9UKN7 3530 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENND4CQ5VZ89 1909 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL4A2P08572 1712 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS13AQ96RL7 3174 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A8MXQ7 604 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM66O15016 1216 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VNN1O95497 513 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLG4P78352 724 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ENPEPQ07075 957 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZACNQ401N2 412 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF667Q5HYK9 610 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP135Q66GS9 1140 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STKLD1Q8NE28 680 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C8orf48Q96LL4 319 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRDQ9H2X0 955 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMAN1LQ9HAT1 526 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME7Q9Y5B8 376 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TADA3O75528 432 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRNB1P11230 501 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 P4HA1P13674 534 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PFKLP17858 780 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NR2F2P24468 414 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANXA13P27216 316 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP3CCP48454 512 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NOP14P78316 857 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF699Q32M78 642 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MDH1BQ5I0G3 518 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SV2AQ7L0J3 742 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFYVE19Q96K21 471 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GKN1Q9NS71 199 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTSE1Q9NYZ3 720 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L7P0C7H9 530 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTHP32929 405 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE6CP51160 858 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VAMP7P51809 220 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM160A1Q05DH4 1040 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTAPQ13126 283 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NELL1Q92832 810 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNIP3Q96KP6 325 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTLL2Q9BWV7 592 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELOVL4Q9GZR5 314 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPEP3Q9H4B8 488 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCL26Q9Y258 94 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 R4GN57 208 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM186AA6NE01 2351 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKAP3O75969 853 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMNAP02545 664 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDH8P55286 799 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAM9Q13443 819 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC32Q14392 662 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EDRF1Q3B7T1 1238 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DGKKQ5KSL6 1271 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf220Q5T0J3 134 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GSDMAQ96QA5 445 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2S1Q96SQ9 504 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B3GNT5Q9BYG0 378 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RMND1Q9NWS8 449 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCNT4Q9P109 453 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMDP11532 3685 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F8VP50 259 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASS1P00966 412 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT13P13646 458 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCF3P15923 654 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms