RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 A0A1B0GUA9 196 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 H0Y8X5 98 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 TCEA3O75764 348 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 OAZ2O95190 189 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CHGBP05060 677 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CPB1P15086 417 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CD27P26842 260 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 NUDT1P36639 197 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 C21orf59P57076 290 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 MMP21Q8N119 569 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 NF1P21359 2839 aa6.85□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CSO75390 466 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 PRKCGP05129 697 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 TYMPP19971 482 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ATP2B1P20020 1258 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ABCB4P21439 1286 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SEC13P55735 322 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ITPR2Q14571 2701 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CYP26A1O43174 497 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 OPA1O60313 960 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 JAK2O60674 1132 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 USP12O75317 370 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 DDAH1O94760 285 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 B3GAT3O94766 335 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 FGAP02671 866 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 STARD3Q14849 445 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SEC23AQ15436 765 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 GAB4Q2WGN9 574 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CENPPQ6IPU0 288 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 TMEM159Q96B96 161 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 LURAP1Q96LR2 239 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ANO3Q9BYT9 981 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CDH18-210ENST00000511273 NEDD4P46934 1319 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 STK36Q9NRP7 1315 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 CLDN1O95832 211 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 NFICP08651 508 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 CIITAP33076 1130 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 PER3P56645 1201 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 NLRP12P59046 1061 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 AMHR2Q16671 573 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 INF2Q27J81 1249 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 HS1BP3Q53T59 392 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 CCDC157Q569K6 752 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 MANEAQ5SRI9 462 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 C12orf40Q86WS4 652 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 FRMD1Q8N878 549 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 A0A1W2PQF6 199 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 CYTH3O43739 400 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 CSH1P0DML2 217 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 CSH2P0DML3 217 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 TIE1P35590 1138 aa6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CDH18-210ENST00000511273 POLE2P56282 527 aa6.83□□□□□ -1.32
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