RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RSPH3Q86UC2 560 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TEKT5Q96M29 485 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 INTS13Q9NVM9 706 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PALLDQ8WX93 1383 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PROP1O75360 226 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ODF1Q14990 250 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CLNKQ7Z7G1 428 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CFAP52Q8N1V2 620 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TMIEQ8NEW7 156 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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PDE4D-217ENST00000509355 GCC1Q96CN9 775 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 NEU2Q9Y3R4 380 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ADGRB1O14514 1584 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 NSD2O96028 1365 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SHTN1A0MZ66 631 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 WDR27A2RRH5 827 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 E9PLN8 166 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 YY2O15391 372 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 MPPED1O15442 326 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ELFN1P0C7U0 828 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 GUCY2FP51841 1108 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TMF1P82094 1093 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 GRM1Q13255 1194 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PTPRRQ15256 657 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB115Q30KQ5 88 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 LPIN2Q92539 896 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ANKS1AQ92625 1134 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TIMP4Q99727 224 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 KLK15Q9H2R5 256 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 E7ENX8 843 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PEX1O43933 1283 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CD1AP06126 327 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 MYBL2P10244 700 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
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PDE4D-217ENST00000509355 FOXF2Q12947 444 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ACAP2Q15057 778 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 KAT5Q92993 513 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TNKSO95271 1327 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 F2RL2O00254 374 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 KATNA1O75449 491 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
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PDE4D-217ENST00000509355 KCNA3P22001 575 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SOX10P56693 466 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 MC2RQ01718 297 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF844Q08AG5 666 aa5.97□□□□□ -1.45
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PDE4D-217ENST00000509355 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CDYLQ9Y232 598 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 COL18A1P39060 1754 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.96□□□□□ -1.46
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