RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504849.5

RFC1-208, Transcript of replication factor C subunit 1, human

TSL 3

Gene RFC1, Length 873 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFC1-208	ENST00000504849	RAB1A	P62820	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TPM4	P67936	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FSTL1	Q12841	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	IDI1	Q13907	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PRKG1	Q13976	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	DAG1	Q14118	895 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TOMM20	Q15388	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TAF12	Q16514	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FATE1	Q969F0	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RGMA	Q96B86	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FOXP2	O15409	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ORC4	O43929	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ONECUT2	O95948	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KNG1	P01042	644 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PYGL	P06737	847 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	LPL	P06858	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TPM1	P09493	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PTGS1	P23219	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	GJB2	P29033	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZNF75D	P51815	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MAP2K6	P52564	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	LGALS4	P56470	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	GSDMD	P57764	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HERVK_113	P62684	666 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FGL2	Q14314	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SEC23A	Q15436	765 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TTC14	Q96N46	770 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RFC1-208	ENST00000504849	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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