RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502929.5

MATR3-232, Transcript of matrin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MATR3, Length 4,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3-232ENST00000502929 ERBB2P04626 1255 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 RBP3P10745 1247 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 MIPP30301 263 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 TFDP2Q14188 446 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CNGA2Q16280 664 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 USP18Q9UMW8 372 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PPFIA2O75334 1257 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PGK1P00558 417 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 HMGCRP04035 888 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ETS1P14921 441 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PROZP22891 400 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 TAF6P49848 677 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CABS1Q96KC9 395 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZBED1O96006 694 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 KCNA4P22459 653 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZNF132P52740 706 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 BCAR1P56945 870 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 OGDHQ02218 1023 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 POU5F1BQ06416 359 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FAM187BQ17R55 369 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CENPUQ71F23 418 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SPATA18Q8TC71 538 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PPEF2O14830 753 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 RIPK2O43353 540 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ECHS1P30084 290 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CHKAP35790 457 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PTK6Q13882 451 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 RNF34Q969K3 372 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 TNIP3Q96KP6 325 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ABLIM1O14639 778 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CCDC130P13994 396 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 AKR1A1P14550 325 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SNX17Q15036 470 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 RGMBQ6NW40 437 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CNPY3Q9BT09 278 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FAM189A1O60320 539 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 STX2P32856 288 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 MAGEA4P43358 317 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 LRRC14Q15048 493 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 SV2CQ496J9 727 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 NLRP14Q86W24 1093 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 LHX5Q9H2C1 402 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.49□□□□□ -1.05
MATR3-232ENST00000502929 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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