RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CHST3Q7LGC8 479 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 REPS2Q8NFH8 660 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF570Q96NI8 536 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 AMNQ9BXJ7 453 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MVJ9 347 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 H0Y626 953 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCY1B2O75343 617 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SELLP14151 372 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CCND2P30279 289 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GBP1P32455 592 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SOX6P35712 828 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP25P42331 645 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SULT1E1P49888 294 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ST13P50502 369 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CTDSPL2Q05D32 466 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO1EQ12965 1108 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 YME1L1Q96TA2 773 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SENP1Q9P0U3 644 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 K7ENM7 598 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 APOL1O14791 398 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SMPD1P17405 629 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ARFIP1P53367 373 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 EVX2Q03828 476 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 VAC14Q08AM6 782 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TPGS2Q68CL5 300 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC25Q86WR0 208 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DTX3Q8N9I9 347 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC63Q8NA47 563 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PJA1Q8NG27 643 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLQ8NG68 377 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF139Q8WU17 664 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RAPGEF5Q92565 580 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR24Q96S15 920 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PLIN2Q99541 437 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MIS12Q9H081 205 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 VCX3AQ9NNX9 186 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 EHD3Q9NZN3 535 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FNIP2Q9P278 1114 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH1P12882 1939 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 F8W810 466 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2MP0CAP2 368 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 VBP1P61758 197 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CSNK2BP67870 215 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NKX3-2P78367 333 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT6Q14141 434 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 IL23RQ5VWK5 629 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 AGR3Q8TD06 166 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms