RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	MAGEA11	P43364	429 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	EPHA5	P54756	1037 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	INCA1	Q0VD86	236 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	MAN2A1	Q16706	1144 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	POTEH	Q6S545	545 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PARM1	Q6UWI2	310 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FUK	Q8N0W3	1084 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	KCNK16	Q96T55	309 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	KCNK12	Q9HB15	430 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM66	O15016	1216 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FGF19	O95750	216 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ALAD	P13716	330 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	CD19	P15391	556 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	RAD23B	P54727	409 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	APBA1	Q02410	837 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	HTR4	Q13639	388 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	VWA3B	Q502W6	1294 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GPR158	Q5T848	1215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FGF14	Q92915	247 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	BEST1	O76090	585 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	NOL4	O94818	638 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ABL1	P00519	1130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	CALCA	P01258	141 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	F11	P03951	625 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FAM200B	P0CF97	657 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	CDC25C	P30307	473 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	USP46	P62068	366 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ZXDA	P98168	799 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	MYL5	Q02045	173 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TDG	Q13569	410 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TTC39C	Q8N584	583 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TTC16	Q8NEE8	873 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA17	Q96L03	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	C8orf48	Q96LL4	319 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	SMO	Q99835	787 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	VPS16	Q9H269	839 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	NDST4	Q9H3R1	872 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CALD1-223	ENST00000496024	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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