RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495491.5

HCLS1-211, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,219 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-211	ENST00000495491	MTF1	Q14872	753 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PON2	Q15165	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CSRP2	Q16527	193 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DDR2	Q16832	855 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	OLFM2	O95897	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	LMO2	P25791	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FNTB	P49356	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	AP3M2	P53677	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ASIC1	P78348	528 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DHX58	Q96C10	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TRIM66	O15016	1216 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MYL1	P05976	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GJA4	P35212	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC7A9	P82251	487 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DMWD	Q09019	674 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	EML3	Q32P44	896 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.71	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	SLC30A4	O14863	429 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	ATP2C2	O75185	946 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	F13A1	P00488	732 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	ARSA	P15289	507 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	LIMK1	P53667	647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	PSMD2	Q13200	908 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	SYT13	Q7L8C5	426 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	TCHH	Q07283	1943 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-211	ENST00000495491	HCRT	O43612	131 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms