RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492729.1

CREB3L4-213, Transcript of cAMP responsive element binding protein 3 like 4, human

TSL 5

Gene CREB3L4, Length 835 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREB3L4-213	ENST00000492729	CCDC130	P13994	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NPR3	P17342	541 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ACADSB	P45954	432 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	AMPD2	Q01433	879 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SCML4	Q8N228	414 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	RAD9A	Q99638	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729		H7C4K7	107 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PALM	O75781	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SOD2	P04179	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ERBB2	P04626	1255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CASQ1	P31415	396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PPM1A	P35813	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TSPY1	Q01534	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TULP2	O00295	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MAN1A1	P33908	653 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SLC8A3	P57103	927 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	DSG1	Q02413	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	GPR17	Q13304	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CD101	Q93033	1021 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SMO	Q99835	787 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ALG6	Q9Y672	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729		E5RJQ4	531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	CES2	O00748	559 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CREB3L4-213	ENST00000492729	LILRB3	O75022	631 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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