RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLIT1O75093 1534 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GABBR2O75899 941 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYO1DO94832 1006 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 THOP1P52888 689 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP4P98171 946 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPATQ06203 517 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FANCBQ8NB91 859 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT35Q92764 455 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 THAP11Q96EK4 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FEM1CQ96JP0 617 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 C8orf48Q96LL4 319 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 C9orf72Q96LT7 481 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM20AQ96MK3 541 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACAP3Q96P50 834 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SATB2Q9UPW6 733 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 POTECB2RU33 542 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS13O14921 159 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 H2AFZP0C0S5 128 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYL2P10916 166 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL6A1P12109 1028 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 JAK1P23458 1154 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADCY8P40145 1251 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GALCP54803 685 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 BNIP3Q12983 259 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CALCOCO2Q13137 446 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 OXA1LQ15070 435 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM16LQ309B1 348 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 BOLA3Q53S33 107 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 H2AFVQ71UI9 128 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH7Q9ULB5 785 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB26Q9ULW5 256 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENPP3O14638 875 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDE8AO60658 829 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAGAP17050 411 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT4P19013 534 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRM5P41594 1212 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPEPPSP55786 919 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPTEP56180 551 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A3Q00325 362 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT76Q01546 638 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNEQ04844 493 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLRX5Q86SX6 157 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 OLFM1Q99784 485 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACP6Q9NPH0 428 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSEQ9UL01 958 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCINQ9Y6U3 715 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPEF2Q9C093 1822 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PPW3 197 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 E5RJQ4 531 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 ESRRBO95718 433 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLCG1P19174 1290 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAT2P52630 851 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC18A1P54219 525 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH15P55291 814 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 P2RX3P56373 397 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP2R2BQ00005 443 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNA12Q03113 381 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGD3Q5JSP0 725 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA2D3-210ENST00000490478 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms