RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490437.5

SRI-210, Transcript of sorcin, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRI, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRI-210ENST00000490437 NCOA7Q8NI08 942 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 GDPD5Q8WTR4 605 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 EDAQ92838 391 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CDHR1Q96JP9 859 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 RPS6KC1Q96S38 1066 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 SMOC1Q9H4F8 434 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 L2HGDHQ9H9P8 463 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 SLC6A20Q9NP91 592 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 INCENPQ9NQS7 918 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 DTLQ9NZJ0 730 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 SIT1Q9Y3P8 196 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 INSL6Q9Y581 213 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 NUB1Q9Y5A7 615 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CACNA1FO60840 1977 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PLIN4Q96Q06 1357 aa3□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MYH2Q9UKX2 1941 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CENPFP49454 3210 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 NEDD4P46934 1319 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 A0A1W2PQU0 124 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TCRBV5S2A0A599 114 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 DENND3A2RUS2 1198 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 B2RBV5 119 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 KRIT1O00522 736 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 WNT9AO14904 365 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ZBTB5O15062 677 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 FIBPO43427 364 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 RAMP2O60895 175 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MMP3P08254 477 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 STAG3L1P0CL83 205 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CALM1P0DP23 149 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CALM2P0DP24 149 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CALM3P0DP25 149 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CKBP12277 381 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ALADP13716 330 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PTGS1P23219 599 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 FPR2P25090 351 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MAN1A1P33908 653 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CDK7P50613 346 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PPP2R2AP63151 447 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TFF2Q03403 129 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 POU5F1BQ06416 359 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PPFIA1Q13136 1202 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ADAM9Q13443 819 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 GPM6BQ13491 265 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 SERINC3Q13530 473 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ALX1Q15699 326 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ODR4Q5SWX8 454 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TCTN3Q6NUS6 607 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TAPT1Q6NXT6 567 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TEPPQ6URK8 271 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TBC1D10CQ8IV04 446 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 USP38Q8NB14 1042 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 RNF169Q8NCN4 708 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PPTC7Q8NI37 304 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 APBB2Q92870 758 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PPP1R14AQ96A00 147 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PKNOX2Q96KN3 472 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CLIC6Q96NY7 704 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 RAD9AQ99638 391 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 LZTS2Q9BRK4 669 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CPVLQ9H3G5 476 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MMRN2Q9H8L6 949 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PXMP2Q9NR77 195 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 IL17RBQ9NRM6 502 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CLDND1Q9NY35 253 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 HDAC6Q9UBN7 1215 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ANAPC4Q9UJX5 808 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 BRCA2P51587 3418 aa2.99□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MAST2Q6P0Q8 1798 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 MYH13Q9UKX3 1938 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 NCK2O43639 380 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 DLX3O60479 287 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 STAM2O75886 525 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 ONECUT2O95948 504 aa2.98□□□□□ -1.93
SRI-210ENST00000490437 CD4P01730 458 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms