RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD63C9JTQ0 380 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 RHOBTB1O94844 696 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 APBB3O95704 486 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 PROS1P07225 676 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 GBP1P32455 592 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCB1Q12824 385 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DMC1Q14565 340 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 PDGFRLQ15198 375 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ADALQ6DHV7 355 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 MON1AQ86VX9 555 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CPA6Q8N4T0 437 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ASB7Q9H672 318 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPC7Q9HCX4 862 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 INVSQ9Y283 1065 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 C2CD2Q9Y426 696 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPRDP23468 1912 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 KRT18P05783 430 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 C1QTNF9P0C862 333 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SCP2P22307 547 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF131P52739 623 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPY1Q01534 308 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXC1Q12948 553 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 MTF1Q14872 753 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DDR2Q16832 855 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXO43Q4G163 708 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 RILPL1Q5EBL4 403 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SYT13Q7L8C5 426 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC15Q8TF66 581 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 EXOC4Q96A65 974 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ECT2Q9H8V3 914 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 KCND1Q9NSA2 647 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 WNT6Q9Y6F9 365 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 LNP1A1A4G5 178 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 KPNA7A9QM74 516 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TADA3O75528 432 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CSH1P0DML2 217 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CSH2P0DML3 217 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 GJB2P29033 226 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 IFNAR2P48551 515 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DGKEP52429 567 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 MCM6Q14566 821 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SV2CQ496J9 727 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ATL3Q6DD88 541 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CD101Q93033 1021 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ACDQ96AP0 544 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CALML4Q96GE6 196 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC22A12Q96S37 553 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 FIZ1Q96SL8 496 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP2S1Q96SQ9 504 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TPSD1Q9BZJ3 242 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 EBF1Q9UH73 591 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CKMP06732 381 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SPINK2P20155 84 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP2F1P24903 491 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 GTF2BQ00403 316 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF77Q15935 545 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa12.61□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SOBPA7XYQ1 873 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 UBA7P41226 1012 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SEC13P55735 322 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC142Q17RM4 750 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 EML3Q32P44 896 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SLFN12LQ6IEE8 588 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SARM1Q6SZW1 724 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP2A3Q93084 1043 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF560Q96MR9 790 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 LAMA5O15230 3695 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-207ENST00000484547 SMTNL1A8MU46 457 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms