RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482771.1

TMEM54-206, Transcript of transmembrane protein 54, human

TSL 2

Gene TMEM54, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM54-206	ENST00000482771	WNT7B	P56706	349 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MYL7	Q01449	175 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KIF2C	Q99661	725 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771		H3BQV1	296 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MAP3K13	O43283	966 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	HCRT	O43612	131 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ITGB3	P05106	788 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	OPRD1	P41143	372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	GRIN1	Q05586	938 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KCNB1	Q14721	858 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MYMK	A6NI61	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ATP2C2	O75185	946 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	NFATC1	O95644	943 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KRT19	P08727	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SLC6A11	P48066	632 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LHX1	P48742	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ZXDB	P98169	803 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KCNA1	Q09470	495 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	USP4	Q13107	963 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CRY1	Q16526	586 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	NUP205	Q92621	2012 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LEFTY2	O00292	366 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	GABRD	O14764	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TCF3	P15923	654 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	PCSK1	P29120	753 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	RBP5	P82980	135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM54-206	ENST00000482771	LMO2	P25791	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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