RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153		M0QYV0	167 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	C8A	P07357	584 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	FOSL2	P15408	326 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	GRIK1	P39086	918 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	CNGA2	Q16280	664 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	DDR2	Q16832	855 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18	6e-13	■■■■□ 19.5
SUMO3-206	ENST00000479153	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SUMO3-206	ENST00000479153	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153		F8VP50	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	TULP2	O00295	520 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	MED7	O43513	233 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	RFPL2	O75678	378 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	GLP2R	O95838	553 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	SMO	Q99835	787 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	NPR3	P17342	541 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CHRNB2	P17787	502 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	FMO1	Q01740	532 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PDE4C	Q08493	712 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	TWF1	Q12792	350 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	KCNC3	Q14003	757 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	STIL	Q15468	1287 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PIK3R2	O00459	728 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CCL16	O15467	120 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	ATF6	P18850	670 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PRKCI	P41743	596 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	BCAT1	P54687	386 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CDR2	Q01850	454 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	CHP1	Q99653	195 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	COL6A3	P12111	3177 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SUMO3-206	ENST00000479153	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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