RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 NCDNQ9UBB6 729 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 HPSEQ9Y251 543 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2W5A6NFC9 320 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 SPTLC2O15270 562 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 PJA2O43164 708 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 PIAS2O75928 621 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CSF1P09603 554 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 PFKLP17858 780 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FDXRP22570 491 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 MCM2P49736 904 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 PTTG1IPP53801 180 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 NCKAP1LP55160 1127 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 RAP2BP61225 183 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF15Q12870 199 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 GPS1Q13098 491 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP1A4Q13733 1029 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 MYBPC2Q14324 1141 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM60Q495X7 471 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 AGBL4Q5VU57 503 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 DTX1Q86Y01 620 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CPT1BQ92523 772 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF125Q96EQ8 232 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT11Q96G61 164 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 KIRREL1Q96J84 757 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 GHITMQ9H3K2 345 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS28Q9UK41 221 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-209ENST00000473406 CDHR4A6H8M9 788 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 E9PLN8 166 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 J3KTA2 159 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN3O60637 253 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ARP10275 920 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1B1P15121 316 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGB5P18084 799 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCD3P28288 659 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINA4P29622 427 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNC1P48547 511 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 RRADP55042 308 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 CLRN1P58418 232 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 DLG4P78352 724 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT2Q10471 571 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 GRM4Q14833 912 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ACAP1Q15027 740 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 MANEALQ5VSG8 457 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT13Q7L8C5 426 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 USP38Q8NB14 1042 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 NELL1Q92832 810 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 NOX5Q96PH1 765 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 RASAL1O95294 804 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 POMCP01189 267 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCY7P51828 1080 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM8P78325 824 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT17Q04695 432 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms