RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-205ENST00000468371 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF263O14978 683 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SYN3O14994 580 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 EXTL3O43909 919 aa6.31□□□□□ -1.4
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