RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HPSEQ9Y251 543 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GREB1Q4ZG55 1949 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GPR179Q6PRD1 2367 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TACC1O75410 805 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PDGFRBP09619 1106 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TDGF1P13385 188 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CASP4P49662 377 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TNNC1P63316 161 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WDR44Q5JSH3 913 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAMSTRQ6ZN01 415 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SUMF1Q8NBK3 374 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RIN3Q8TB24 985 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLEKHO2Q8TD55 490 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATRIPQ8WXE1 791 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TDP1Q9NUW8 608 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP25Q9UHP3 1055 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NME7Q9Y5B8 376 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LILRB5O75023 590 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 STAU1O95793 577 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BDNFP23560 247 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCR3P51677 355 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYL6P60660 151 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP27A1Q02318 531 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSMD2Q13200 908 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRPC3Q13507 836 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAS6Q14393 721 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PON2Q15165 354 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MDH1BQ5I0G3 518 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VSTM1Q6UX27 236 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PCED1BQ96HM7 432 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HINFPQ9BQA5 517 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM83CQ9BQN1 747 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 XYLT2Q9H1B5 865 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNX25Q9H3E2 840 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRPC7Q9HCX4 862 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GKN1Q9NS71 199 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYL1P05976 194 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SATB1Q01826 763 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GSE1Q14687 1217 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP2R5DQ14738 602 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6ZS52 159 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OR6B3Q8NGW1 331 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RUBCNQ92622 972 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPATA17Q96L03 361 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KCTD10Q9H3F6 313 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HPS4Q9NQG7 708 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DMAC2Q9NW81 257 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHACTR2O75167 634 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM163BP0C2L3 166 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANXA13P27216 316 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATICP31939 592 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRIK1P39086 918 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYKP43405 635 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFA8P51970 172 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BIRC3Q13489 604 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DGKKQ5KSL6 1271 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC9A9Q8IVB4 645 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPEM1Q8N4L4 309 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FSIP1Q8NA03 581 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PARD3BQ8TEW8 1205 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM174Q8WUU8 243 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEP295NLQ96MC4 621 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC22A12Q96S37 553 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DPEP3Q9H4B8 488 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EBF3Q9H4W6 596 aa19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRIM66O15016 1216 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPN1P04843 607 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CKMP06732 381 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP17L7P0C7H9 530 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARSAP15289 507 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CXCL12P48061 93 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AP3M2P53677 418 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP46P62068 366 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CLDN10P78369 228 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP4Q13107 963 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RUNX3Q13761 415 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCINQ13939 588 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MTF1Q14872 753 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF77Q15935 545 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF699Q32M78 642 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa19.44■□□□□ 0.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EPC1Q9H2F5 836 aa19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms