RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449508.1

TOM1-211, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 4

Gene TOM1, Length 593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-211ENST00000449508 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 EXOC3O60645 756 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TADA3O75528 432 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 USP17L7P0C7H9 530 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 BDNFP23560 247 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 FOXK2Q01167 660 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CYP27A1Q02318 531 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CCINQ13939 588 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 VSTM1Q6UX27 236 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 Q6ZS52 159 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TTC16Q8NEE8 873 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 ZNF516Q92618 1163 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 MYLPFQ96A32 169 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 HPS4Q9NQG7 708 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 RAB23Q9ULC3 237 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CEP250Q9BV73 2442 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PHACTR2O75167 634 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TACC1O75410 805 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CKMP06732 381 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 FAM163BP0C2L3 166 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SLFN14P0C7P3 912 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ANXA13P27216 316 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TNNC1P63316 161 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 AMPD2Q01433 879 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 RMDN1Q96DB5 314 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PAGE5Q96GU1 130 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PCED1BQ96HM7 432 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SPATA17Q96L03 361 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SLC22A12Q96S37 553 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PTPRDP23468 1912 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 A0A1B0GVL5 298 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 C2orf78A6NCI8 922 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 KLRC4O43908 158 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ARSAP15289 507 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 HDCP19113 662 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 FNTBP49356 437 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CASP4P49662 377 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 MYL6P60660 151 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 STK4Q13043 487 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PSMD2Q13200 908 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 MTF1Q14872 753 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PDGFRLQ15198 375 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 LPAL2Q16609 132 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 RIN3Q8TB24 985 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 EXOC1Q9NV70 894 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 A8MXQ7 604 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 K7ESF4 209 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TRIM66O15016 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CLSTN1O94985 981 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CMA1P23946 247 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ATICP31939 592 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GALK1P51570 392 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 USP46P62068 366 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DMWDQ09019 674 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 BIRC3Q13489 604 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 KCNB1Q14721 858 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 LONP2Q86WA8 852 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SPATA32Q96LK8 384 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 EHD2Q9NZN4 543 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GCNT4Q9P109 453 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 NME7Q9Y5B8 376 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 F8VP50 259 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms