RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 NDUFA8P51970 172 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 VSTM1Q6UX27 236 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PCED1BQ96HM7 432 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 MYRFLQ96LU7 910 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 EBF3Q9H4W6 596 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 HPSEQ9Y251 543 aa20.89■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SOBPA7XYQ1 873 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 TADA3O75528 432 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L7P0C7H9 530 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CXCL12P48061 93 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 NRLP54845 237 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 KCNB1Q14721 858 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF699Q32M78 642 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CEP135Q66GS9 1140 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PATJQ8NI35 1801 aa20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM66O15016 1216 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 KIF20AO95235 890 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 NR3C1P04150 777 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 AP3M2P53677 418 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 RUNX3Q13761 415 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 RUBCNQ92622 972 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA17Q96L03 361 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 F5P12259 2224 aa20.87■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PDXKO00764 312 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PRR29P0C7W0 189 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SATB1Q01826 763 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 NCOA4Q13772 614 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 Q6ZS52 159 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SLC22A12Q96S37 553 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DMAC2Q9NW81 257 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 EHD2Q9NZN4 543 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 NCDNQ9UBB6 729 aa20.86■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 C2orf78A6NCI8 922 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 F8VP50 259 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ABL1P00519 1130 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 FAM163BP0C2L3 166 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ARSAP15289 507 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 HDCP19113 662 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 RAP1GAPP47736 663 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CDH8P55286 799 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 AMPD2Q01433 879 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 GAS6Q14393 721 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 BECN1Q14457 450 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 MTF1Q14872 753 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DCLK2Q8N568 766 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 MED10Q9BTT4 135 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 HPS4Q9NQG7 708 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 NME7Q9Y5B8 376 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 FAM186AA6NE01 2351 aa20.85■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CLDN5O00501 218 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 USP46P62068 366 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DLG4P78352 724 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 PDGFRLQ15198 375 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 RIN3Q8TB24 985 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NPAS1-201ENST00000439365 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms