RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACP6Q9NPH0 428 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TULP2O00295 520 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPHB6O15197 1021 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NARSO43776 548 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AP1G2O75843 785 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRAMEF12O95522 483 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 P4HA1P13674 534 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF18P17022 549 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GABRR2P28476 465 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGFP49763 221 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPHA5P54756 1037 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UVSSAQ2YD98 709 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM65Q6PJ69 517 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPM1KQ8N3J5 372 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TFAP2BQ92481 460 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FGF14Q92915 247 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNK16Q96T55 309 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KXD1Q9BQD3 176 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MED10Q9BTT4 135 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASAH2Q9NR71 780 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM50BQ9Y247 325 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BECN2A8MW95 431 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PES1O00541 588 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PMM2O15305 246 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOL4O94818 638 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PON1P27169 355 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAGEA11P43364 429 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALDH1A3P47895 512 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPHB3P54753 998 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNMA1Q12791 1236 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HTR4Q13639 388 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IQCB1Q15051 598 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VWA3BQ502W6 1294 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR44Q5JSH3 913 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IER5LQ5T953 404 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM270Q6UE05 265 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PARM1Q6UWI2 310 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C4orf50Q6ZRC1 276 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LUZP1Q86V48 1076 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTC30AQ86WT1 665 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCAMP5Q8TAC9 235 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NT5C1AQ9BXI3 368 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR88Q9GZN0 384 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VPS16Q9H269 839 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NDST4Q9H3R1 872 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CBX8Q9HC52 389 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABCB6Q9NP58 842 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LIMD1Q9UGP4 676 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DPP7Q9UHL4 492 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDH7Q9ULB5 785 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUMBLQ9Y6R0 609 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HHLA1C9JL84 531 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNFRSF10AO00220 468 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DLL1O00548 723 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 P4HA2O15460 535 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFHP08603 1231 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTPN2P17706 415 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRIK1P39086 918 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF132P52740 706 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC5A3P53794 718 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP3K7CLP57077 242 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VEPH1Q14D04 833 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IQCEQ6IPM2 695 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UNC93AQ86WB7 457 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms