RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ANO5Q75V66 913 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 BICD1Q96G01 975 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 GABBR1Q9UBS5 961 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 VWA5AO00534 786 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 IL1BP01584 269 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PGM1P36871 562 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC38Q5VT99 294 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SESTD1Q86VW0 696 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PPIL6Q8IXY8 311 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CEP170P1Q96L14 293 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KMT5AQ9NQR1 393 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 F8W8V4 182 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LPXNO60711 386 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MICALL2Q8IY33 904 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BSNDQ8WZ55 320 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HAUS1Q96CS2 278 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GBP5Q96PP8 586 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FCHO1O14526 889 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEC1O60732 1142 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB7AO95365 584 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NR3C2P08235 984 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GNA15P30679 374 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 JAK3P52333 1124 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KRT76Q01546 638 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PLCB3Q01970 1234 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GAD2Q05329 585 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MSS51Q4VC12 460 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF516Q92618 1163 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HACL1Q9UJ83 578 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 POLIQ9UNA4 740 aa15.64■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SMAPO00193 183 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ETV4P43268 484 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TTC7BQ86TV6 843 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RHPN2Q8IUC4 686 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35B2Q8TB61 432 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 E7ESA3 106 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PIAS1O75925 651 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RNF8O76064 485 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-DRAP01903 254 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MT-ND3P03897 115 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MYL2P10916 166 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 AMPD1P23109 780 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NEK3P51956 506 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HMGCS2P54868 508 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NBPF20Q3BBV1 942 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCNJLQ8IV13 435 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CPT1BQ92523 772 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 APOPT1Q96IL0 206 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM213AQ9BRX8 229 aa15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF862O60290 1169 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM191BP0C7N4 346 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GARTP22102 1010 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINB4P48594 390 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CUL3Q13618 768 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 POTEAQ6S8J7 498 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM161BQ96MY7 647 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ANKEF1Q9NU02 776 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LYNP07948 512 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TSHRP16473 764 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BGNP21810 368 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCND2P30279 289 aa15.62■□□□□ 0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SFNP31947 248 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms