RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 TAP1Q03518 808 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 INCA1Q0VD86 236 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GPS1Q13098 491 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MMRN1Q13201 1228 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MPP2Q14168 576 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ACTL9Q8TC94 416 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 KAT2BQ92831 832 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 OSMRQ99650 979 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SYNCQ9H7C4 482 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 KDELR1P24390 212 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GABRB2P47870 512 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MTM1Q13496 603 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 VSTM1Q6UX27 236 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.061e-18■■■□□ 14.6
RBM39-212ENST00000429968 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TBK1Q9UHD2 729 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CST8O60676 142 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GCAP28676 217 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ATICP31939 592 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GRM5P41594 1212 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 IFNAR2P48551 515 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 LRRC14Q15048 493 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CNGA2Q16280 664 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TAZQ16635 292 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TTC30AQ86WT1 665 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HSPH1Q92598 858 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 EURLQ9NYK6 297 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C2CD2Q9Y426 696 aa14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C5orf60A6NFR6 353 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 IFNB1P01574 187 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 VDRP11473 427 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 LIG3P49916 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CDR1P51861 262 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 COPS2P61201 443 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ADCY1Q08828 1119 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CCDC142Q17RM4 750 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 NPNTQ6UXI9 565 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ACOT1Q86TX2 421 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CPA4Q9UI42 421 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SGK1O00141 431 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 AKAP5P24588 427 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MAGEA4P43358 317 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RBP5P82980 135 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CAV1Q03135 178 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DGKDQ16760 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CDO1Q16878 200 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SPRYD7Q5W111 196 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PMF1Q6P1K2 205 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MGARPQ8TDB4 240 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CENPTQ96BT3 561 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SNX27Q96L92 541 aa14.65□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms